生物燃料是可再生能源的一种，包括燃料乙醇和生物柴油。近年来，公众对生物燃料的兴趣日益增长，主要基于以下几点：首先，生物燃料是唯一可以大规模替代交通部门汽油和柴油的可再生能源；其次，生物燃料与目前的煤变油、煤基甲醇／二甲醚、汽车动力电能／氢能等替代模式相比具有更高的能源效率和生态环境友好性；另外，生物质制取物质性产品是目前石油化工产品生产的唯一替代渠道。

世界大国都出台了强有力的促进方案。美国２００７年底提出到２０２２年以１．０８亿吨生物燃料替代２０％运输燃料的目标及逐年计划。欧盟２００７年初提出了生物燃料不得少于运输燃料１０％的目标。印度计划到２００８年１０月将乙醇在汽油中添加比例由目前的５％提高到１０％，到２０１７年这个比例要达到２０％。

在世界大国中，中国的生物燃料产业已经显得裹足不前了，除了国家规划严重滞后以外，还存在如下几个主要问题：１．原材料供应问题严重。目前生物燃料的原材料生产的投入基本都是企业行为，由于缺乏基础设施配套，成本很难控制。而生物燃料的原料生产主要在“三农”，产值的六成在“三农”，发展能源农业在促进农业发展、农村城镇化、农民增收致富和解决剩余劳动力方面具有很大现实意义。然而，目前生物燃料产业似乎与农业关系并不大。

２．转化技术比较落后。目前我国的燃料乙醇主要是利用糖和淀粉发酵来制取，技术比较成熟，但被誉为“第二代燃料乙醇技术”的纤维素发酵制乙醇技术进展缓慢，与国外差距较大。国外在利用环境非常友好的酶催化技术制取生物柴油方面进展迅速，并且在通过基因工程促进原料高产方面也有长足进展，相较而言，我国的生物柴油技术进展缓慢。

３．资金投入明显不足。生物燃料的生产属于高新技术和新兴产业，其技术研发和市场培育需要大量资金投入，但目前投融资渠道较为单一，国家及地方政府财政投入严重不足，部分领域研发能力弱，技术水平较低，制约了技术创新和产业化发展。另外，原材料的种植是一项很大的系统工程，单个企业很难实现，这就需要国家相关部门、地方政府、企业等形成一个合作机制，共同推动产业发展。

发展生物燃料是保障国家能源安全的一个重要战略部署，针对目前我国生物产业面临的问题，当前最紧迫需要做的事情有以下几点：

１．将生物燃料产业纳入基础产业的范畴，科学制定发展规划并建立产业发展体系，从根本上解决原材料的供应问题。应该将粮食种植和能源种植这两种相关度极高的产业进行整合，统一进行育种、栽培、收购、调配、销售、技术等综合服务，以最大可能地降低原材料供应成本。

２．大力促进生物燃料的研发与利用。国家应将生物燃料技术研究纳入国家重大科技专项之中，应从原料生产、收集、储存、运输、加工转换、市场流通、终端使用等全产业链考虑，系统地制定技术促进方案。首要解决原料供应、生物燃料制取以及副产物深加工等核心难题。

３．应该积极完善财税扶持政策。由于先期进入生物燃料领域风险较大，市场难以预计，这很大程度影响了产业发展初期企业进入的积极性。对于先期进入原料种植的企业，应该为其滚动开发创造条件，银行应该允许这些企业通过已经种植的植被进行抵押贷款。也可以建立生物燃料发展的风险基金制度，对生物燃料生产企业的亏损实施弹性补贴，以吸引足够多的企业进入生物燃料领域，随着产业不断发展该补贴可逐年降低。