对于未来汽车内燃机的燃料，人们也做了大量的研究和发展。石油作为化石类燃料毕竟迟早要枯竭。根本解决问题的办法是寻找能永久替代石油的燃料。目前对石油替代燃料的研究所作的研究表明，天然气、液化石油气等燃料也有用尽的一天，惟有水和太阳能的能源是永恒的。因此，生物质制燃料是未来彻底解决汽车内燃机能源的最重要途径之一。

当今欧洲、美国和日本都对生物质制燃料付之以极大的重视。欧洲已经制定了生物柴油的相应标准。这种生物柴油来源于菜籽油。

2001年欧盟的生物柴油产量突破100万吨，其中法国和德国是最大的生产国。生物柴油可以在现行的柴油机上使用，而不用改装，德国的奔驰、宝马、大众汽车等生产的各种类型柴油发动机都允许使用生物柴油。

美国自20世纪90年代初开始生产生物柴油，1998年制定了相关的技术标准，美国能源部设立了研究开发项目，联邦政府和国会以及有关州政府先后发布和通过了政令和法案，支持生物柴油的生产和消费，到2001 年年产量已达6万吨。

为鼓励广大汽车用户尽可能使用生物柴油，美国能源部采取多条优惠措施，其中包括对生物柴油不征收燃油税。此外，加拿大、巴西、日本、新西兰和其他一些国家也在发展生物柴油技术和产业。

我国自2001年起在部分地区使用乙醇汽油，即在现有的汽油中掺入一定比例的乙醇。乙醇由生物制得，也是一种生物燃料。